حددت وزارة التعليم العالى والمجلس الأعلى للجامعات الضوابط الخاصة بأعضاء اللجنتين المختصتين بترشيح رؤساء الجامعات وعمداء الكليات والمعاهد العليا، ومنها أن يكون من الشخصيات ذات التاريخ العلمى المعروف، والمشهود له بحسن السمعة والسيرة وأن يكون مشهورا عنه الحياد، وعدم الانتماءات الحزبية وألا يكون له مصلحة شخصية فى تقلد المناصب القيادية الجامعية.
ومن ضمن الضوابط ألا تربطه صله قرابة أو نسب بأى من المتقدمين للتعيين حتى الدرجة الرابعة أو شراكة من أى نوع أو خصومة قضائية وفى حالة الاختيار لعضوية أى من اللجنتين، من بين أساتذة الجامعة يتوجب عدم اختيار أكثر من أستاذ واحد من الكلية الواحدة، بالنسبة للجنة الخاصة باختيار رئيس الجامعة.
وبالنسبة للجنة الخاصة باختيار عميد الكلية أو المعهد فيلزم عدم اختيار أكثر من أستاذ واحد من القسم الواحد ويجمد عمل شاغلى القيادات الجامعية الحالية إذا أعربت عن رغبتها فى التقدم لشغل المناصب القيادية الجامعية، وعدم مشاركة أى عضو من أعضاء مجلس الجامعة فى عملية اختيار أعضاء اللجنة الخاصة بترشيح رئيس الجامعة حال إعرابه عن رغبته فى التقدم لشغل المنصب، وذات الشىء بالنسبة لأعضاء مجالس الكليات والمعاهد العليا ويترتب على مخالفة ذلك عدم قبول طلب الترشح